Die Stiftung fördert das öffentliche Gesundheitswesen, die Wohlfahrtspflege sowie die Aus-, Fort- und Weiterbildung in Gesundheitsberufen. Dies geschieht unter anderem durch die Unterstützung medizinischer Forschungsvorhaben und den Betrieb von Krankenhäusern wie dem Lubinus Clinicum und dem Sankt Elisabeth Krankenhaus in Kiel. Darüber hinaus betreibt die Stiftung die Johann Hermann Lubinus Schule für Physiotherapie, die MVZ Lubinus GmbH sowie weitere Dienstleistungs- und Servicegesellschaften, die das umfassende Angebot der Stiftung ergänzen.
